墨盾书院学生会组织开展各式各类的文体活动，丰富同学们的课余文化生活，带领学生遵纪守法，组织学生参与学院的民主管理，正确地履行民主权利和义务，增强学院领导与广大同学的联系，反映学生对书院各项工作的意见和建议，协助书院师生完成各项工作。

墨盾书院学生会分为以下部门：

综合事务中心：负责整理书院档案信息、会议记录，拟定全局工作计划和工作总结及规章制度并督促实施；负责制定本中心日常工作计划，协调日常工作；上情下达、下情上报、关系协调等工作。

学业发展中心：负责学习资源整理，公共课、专业基础课公开学习资料的整理，考研、就业信息的整理、推送；组织开展“校园辩论赛”、“校园演讲比赛”等校园精品学术活动。

活动策划中心：负责书院活动策划书的审核，对活动质量及开展情况的监督评定，组织关于书院的各种活动。